Bókasavnsavtala
Fróðskaparsetrið hevur avtalu við Landsbókasavnið um at tey umsita bókasøvnini á deildunum.

Avtala frá 1994 um bókasøvn

Gransking og útbúgvng í jarðfrøði, jarðalisfrøði og kolvetnisfrøði
19. mars í 2001 skrivaðu Hans Pauli Joensen, deildarleiðari á Náttúruvísindadeildini og Martin Heinesen leiðari á Jarðfrøðisavninum undir samstarvsavtalu. Avtalan skal menna fakliga førleikan innan jarðfrøði, jarðalisfrøði og kolvetnisfrøði. Samstarvið fevnir bæði um gransking og um útbúgving.

Samstarvsavtala millum Jarðfrøðisavnið og Náttúruvísindadeildina

Fróðskaparsetrið hevur samstarvsavtalur við fleiri útlendsk universitet, serliga í norðanlondum. Niðanfyri er yvirlit yvir ymsu avtalurnar við avriti av sjálvum avtalunum.

Háskóli Íslands
Í oktober 2000 skrivaðu rektarin á Fróðskaparsetri Føroya, Malan Marnersdóttir og rektarin á Háskóla Íslands, Páll Skúlason undir viljalýsing um samstarv millum stovnarnar báðar. Yvirlýsingin byggir á ta avtalu, sum var undirskrivað í oktober 1990 av rektarunum báðum (tá vóru Petur Zachariassen og Sigmundur Guðbjarnarson rektarar). Samstarvið er ætlað at fevna um allar greinir, men serligur dentur verður lagdur á verðandi samstarv við Frændafundum og samstarv innan m.a. orðabókafrøði. Eisini verður størri dentur á at samstarv innan løgfrøði. Løgfrøði var tikið við í serliga samstarvsavtalu, millum Søgu- og Samfelagseildina og Lagadeild Háskóla Íslands, sum var undirskrivað í 2002.
Viljayvirlýsing millum Háskóla Íslands og Fróðskaparsetur Føroya 
Samstarvsavtala millum Fróðskaparsetur Føroya og Háskóla Íslands frá 1990 
Yvirlýsing frá Søgu- og samfelagsdeildini og Lagadeild Háskóla Íslands
Avtala við Háskóla Íslands

Háskólin á Akureyri
9. november 2005 skrivaðu Jóan Pauli Joensen, rektari á Fróðskaparsetrinum og Þorsteinn Gunnarsson, rektari á Háskólanum á Akureyri undir eina viljayvirlýsing (letter of intent). Stovnarnir báðir siga at teir vilja arbeiða fyri samstarvi innan gransking og útbúgving við serligum atliti til 3 øki, sum eru: lóg, KT-frøði og umhvørvistøkni.
Viljayvirlýsing millum Háskólan á Akureyri og Fróðskaparsetur Føroya

Høgskolen i Stavanger
Í 1997 skrivaðu Fróðskaparsetrið og Høgskolen í Stavanger undir samstarvsavtlu. Avtalan skal lætta um samksiftið millum stovnarnar báðar, so at serliga avriksflutningur verður lættari. Eisini skal avtalan menna samstarvið millum granskarnar á stovninum.
Samstarvsavtala millum Fróðskaparsetrið og Høgskolen i Stavanger

Historisk Institut, Århus Universitet
Í 2002 hava Søgu-og samfelagsdeildin og Historisk Institit gjørt avtalu um avriksflutning millum deildirnar báðar. Tað merkir millum annað at ein BA útbúgving á aðrari deildini er at sammeta við BA á útbúgving á hinari, eins og avriksflutningurin millum einstakar lærugreinar eisini skal vera lættari.
Samstarvsavtala millum Søgu- og samfelagsdeildina og Historisk Institt Århus Universitet

Samstarvssvtala millum Fróðskaparsetrið, Fiskirannsóknarstovuna og Nansen Center í Bergen
Avtalan skal styrkja havfrøðiliga gransking og samstarvið um hesa á teimum trimum stovnunum.
Samstarvsavtala millum Fróðskaparsetur Føroya, Fiskirannsóknarstovuna og Nansencentrið í Noregi

Biologisk Institut, Københavns Universitet
Í 1995 boðaði Naturvidenskabeligt Fakultet frá, at støðisútbúgvingin í lív-/evnafrøði er at sammeta við teirra 'Basisdel'.
Samstarvsavtala millum Náttúruvísindadeildina og Naturvidenskabeligt Fakultet Københavns Universitet